不过正当飞机设计在逐步完善之时，1944年9月下旬帝国航空部叫停了全部喷气式轰炸机计划，此时Ju-287已经进行了17次试飞。不过随着占据越发不利，纳粹高层开始醉心于秘密武器，1945年3月，Ju 287 计划重新启动，并且帝国航空部下令要求每月产量不低于100架，V3、V4号原型机被要求尽快完工。