研究结果显示，细弱软骨藻的线粒体基因组长度为 25,928bp，AT 含量（72.08%）明显偏高，包含 3 种 rRNA、23 种 tRNA 和 24 种蛋白质编码基因（PCGs）。与其他红藻的线粒体基因组相比，细弱软骨藻的线粒体基因组缺少 rpl5 和 rpl20 基因。

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